微生态制剂是利用有益微生物及其相关物质制成的生物制剂，进入动物肠道后，能调整内部环境，提高机体免疫力，是专门用于动物营养保健的活菌制剂。动物微生态制剂又称为微生物饲料添加剂，主要包括益生菌、益生元、合生元三类制剂。
益生菌是活菌，我国允许使用的益生菌种有干酪乳酸菌、植物乳杆菌、粪链球菌、屎链杆菌、乳酸片球菌、枯草芽孢杆菌、纳豆芽孢杆菌、嗜酸乳杆菌、乳链球菌、啤酒酵母、产朊假丝酵母、沼泽红假单孢菌等12种，可直接饲喂动物。益生元是一类化学物质，不能被宿主消化吸收，也不能被肠道有害菌利用，只能被有益微生物选择性地吸收利用或能促进有益菌的活性或繁殖。合生元为益生菌和益生元按一定比例结合的生物制剂，能同时发挥二者的共同作用。
畜禽生产中使用的微生态制剂主要有EM、益生素、促菌生、调痢生、制菌灵、止痢灵、抗痢灵、抗痢宝、乳酶生等。
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